2023年10月6日,Journal of Genetics and Genomics在线发表复旦大学生命科学学院张一婧研究员团队题为“Triticeae-BGC: a Web-based platform for detecting, annotating and evolutionary analysis of biosynthetic gene clusters in Triticeae”的研究论文。该研究开发了一个小麦族生物合成基因簇的识别、注释和进化分析平台(http://119.78.67.240:3838/Triticeae-BGC/),系统检测了普通小麦中潜在的功能性生物合成基因簇,为关键防御基因的功能注释提供重要资源。
该平台预测了九个小麦族及相关物种(包括普通小麦、野生四倍体小麦、驯化四倍体小麦、乌拉尔图小麦、粗山羊草、黑麦、二穗短柄草、玉米和大麦)中的基因簇,并检索了共表达和共通路的功能信息以过滤假阳性结果。此外,该平台还比较了BGCs的功能蛋白质结构域组成和序列共线性,探究小麦族物种对环境响应的动态进化路径。
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